במסגרת פרויקט שדרוג המערכות הטכנולוגיות ברשות המעברים במשרד הביטחון, הוצב לאחרונה משקף סחורות חדש במעבר שער אפרים. מדובר במשקף הראשון מתוך 5 משקפי סחורות מתוכננים שיוצבו במהלך השנה במעברים: גלבוע, תרקומיה, וביתוניא.
מעבר שער אפרים הינו מעבר מרכזי המאפשר תנועת הולכי רגל ותנועת סחורות הנותן מענה לסחר בין הערים הממוקמות במרכז איו"ש (טול כרם, שכם, קלקיליה וחלק ממחוז ג'נין) לבין ישראל. המעבר ממוקדם צפונה לכביש 557 ודרומית לטול כרם.